前沿 | 沙漠蝗虫基因组测序完成

2022-06-29 10:06:33 31

近日,美国农业部农业研究院(ARS)的一项研究公布了第一个高质量沙漠蝗虫基因组。这项研究是ARS的Ag100Pest计划的一部分。该计划旨在破译对农业和环境产生影响的100种害虫的高质量基因组,供基础和应用研究使用。

沙漠蝗虫是具有毁灭性的贪婪食客,是世界上最具破坏性的迁徙性昆虫。他有巨大的基因组,有近90亿对碱基,数量几乎是人类基因组的3倍。许多沙漠蝗虫个体染色体的大小比一个果蝇的整个基因组都大,就像在小型车旁的18轮货车那样对比鲜明。

“从样本收集到最终基因组组装完成我们用了不到5个月的时间。”该研究小组领导者、ARS昆虫学家ScottM.Geib说,这是迄今完成的最大昆虫基因组之一,都来自一只蝗虫。

Geib说,沙漠蝗虫基因组很大,但片段要少得多,8.8 Gb的基因组只有12条染色体。

沙漠蝗虫会根据降雨和湿度等环境条件定期改变身体形状、行为和繁殖率。它们破坏性巨大,一平方公里的蝗虫群内可容纳多达8000万成年沙漠蝗虫。而一小群蝗虫一天就可以吃掉35000人份的粮食。

沙漠蝗虫灾害呈周期性,最早记录是在公元前3200年古埃及法老时代。近几十年来它们肆虐东非、中东和东南亚等地,对许多国家的粮食安全造成威胁。

“拥有沙漠蝗虫高质量基因组是朝着控制蝗灾迈出的一大步。”Geib说。(来源:中国科学报)